Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMARCA4P51532 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SMARCA4P51532 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms