Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ETV1P50549 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ETV1P50549 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ETV1P50549 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ETV1P50549 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ETV1P50549 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ETV1P50549 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ETV1P50549 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ETV1P50549 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ETV1P50549 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ETV1P50549 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ETV1P50549 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETV1P50549 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETV1P50549 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETV1P50549 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETV1P50549 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETV1P50549 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETV1P50549 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETV1P50549 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETV1P50549 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ETV1P50549 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms