Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD4P46934 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms