Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSFMP43897 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSFMP43897 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSFMP43897 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSFMP43897 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSFMP43897 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSFMP43897 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSFMP43897 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSFMP43897 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSFMP43897 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSFMP43897 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms