Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MDH1P40925 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MDH1P40925 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MDH1P40925 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MDH1P40925 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MDH1P40925 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MDH1P40925 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MDH1P40925 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MDH1P40925 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MDH1P40925 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDH1P40925 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDH1P40925 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDH1P40925 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDH1P40925 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDH1P40925 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDH1P40925 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDH1P40925 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDH1P40925 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDH1P40925 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDH1P40925 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDH1P40925 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MDH1P40925 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms