Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGAEP38570 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms