Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms