Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA1P35221 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA1P35221 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA1P35221 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA1P35221 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA1P35221 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA1P35221 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA1P35221 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA1P35221 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA1P35221 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA1P35221 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA1P35221 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms