Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA4P35212 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA4P35212 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA4P35212 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA4P35212 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA4P35212 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms