Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms