Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms