Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA7P31268 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms