Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCAP28676 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCAP28676 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCAP28676 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms