Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMLP26374 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMLP26374 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMLP26374 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMLP26374 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMLP26374 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMLP26374 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMLP26374 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMLP26374 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMLP26374 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMLP26374 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMLP26374 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMLP26374 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMLP26374 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMLP26374 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMLP26374 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMLP26374 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms