Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YY1P25490 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YY1P25490 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YY1P25490 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YY1P25490 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YY1P25490 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
YY1P25490 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YY1P25490 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YY1P25490 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms