Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRR1P24046 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms