Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRBP23467 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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