Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT1P21579 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT1P21579 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT1P21579 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT1P21579 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT1P21579 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT1P21579 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT1P21579 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT1P21579 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT1P21579 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms