Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN3P20807 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms