Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSMB1P20618 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB1P20618 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB1P20618 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB1P20618 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB1P20618 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB1P20618 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB1P20618 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB1P20618 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB1P20618 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB1P20618 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms