Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
XBP1P17861 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XBP1P17861 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XBP1P17861 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms