Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN2P17655 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN2P17655 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN2P17655 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN2P17655 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms