Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYH3P11055 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYH3P11055 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH3P11055 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms