Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGA3P0DJD8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms