Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00032P0C843 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms