Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSF1RP07333 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms