Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TYMSP04818 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TYMSP04818 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TYMSP04818 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TYMSP04818 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms