Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTAP01040 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTAP01040 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSTAP01040 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSTAP01040 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTAP01040 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTAP01040 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTAP01040 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTAP01040 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTAP01040 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTAP01040 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTAP01040 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSTAP01040 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSTAP01040 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSTAP01040 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTAP01040 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTAP01040 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTAP01040 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTAP01040 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTAP01040 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTAP01040 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTAP01040 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTAP01040 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTAP01040 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTAP01040 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTAP01040 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTAP01040 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms