Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB6O95452 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB6O95452 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB6O95452 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB6O95452 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB6O95452 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB6O95452 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB6O95452 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB6O95452 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB6O95452 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB6O95452 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB6O95452 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB6O95452 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB6O95452 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB6O95452 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB6O95452 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB6O95452 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB6O95452 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms