Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms