Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB11FIP3O75154 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 308.8 ms