Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMFO60524 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMFO60524 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMFO60524 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms