Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PLXNC1O60486 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNC1O60486 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms