Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA5O60264 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms