Protein–RNA interactions for Protein: O60237

PPP1R12B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R12BO60237 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP1R12BO60237 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R12BO60237 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms