Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX6O43752 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX6O43752 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX6O43752 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX6O43752 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX6O43752 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX6O43752 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX6O43752 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STX6O43752 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX6O43752 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX6O43752 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX6O43752 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX6O43752 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX6O43752 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX6O43752 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX6O43752 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX6O43752 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX6O43752 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX6O43752 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX6O43752 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX6O43752 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX6O43752 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX6O43752 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX6O43752 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX6O43752 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX6O43752 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms