Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms