Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP3O43295 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms