Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms