Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
U2SURPO15042 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2SURPO15042 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms