Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H7C1D1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H7C1D1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H7C1D1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H7C1D1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H7C1D1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H7C1D1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H7C1D1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C1D1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C1D1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C1D1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C1D1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms