Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DSR2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DSR2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DSR2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DSR2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms