Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms