Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSDA5PKW4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms