Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VPS37CA5D8V6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms