Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL381P-201ENST00000577658 298 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC245033.3-201ENST00000617986 224 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.212-201ENST00000636778 248 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM222B-201ENST00000341217 4033 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF423-202ENST00000535559 4201 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CBLL1-205ENST00000440859 4432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 DSG4-202ENST00000359747 4526 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ITSN2-213ENST00000622089 5805 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 GSTO2-202ENST00000369707 6423 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 NTRK3-207ENST00000542733 2287 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 GFM2-202ENST00000345239 2856 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MADD-205ENST00000395344 4988 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF1B-205ENST00000377093 7565 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO6-204ENST00000369985 8575 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PAPPA2-202ENST00000367662 9691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SDK2-201ENST00000392650 10723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ELP1-204ENST00000537196 3823 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF182-204ENST00000488300 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 IGSF11-203ENST00000425327 3525 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 DNHD1-202ENST00000354685 3205 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 GAREM1-201ENST00000269209 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 N6AMT1-202ENST00000351429 4781 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CYBRD1-201ENST00000321348 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 STEAP3-203ENST00000393110 4262 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 LACC1-203ENST00000441843 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 C12orf66-202ENST00000398055 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 DENND5A-210ENST00000530044 4060 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 EPHB2-203ENST00000374632 3677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AL590999.1-202ENST00000607215 3053 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MEIS2-202ENST00000338564 4829 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC144B-201ENST00000285176 4310 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 NNT-202ENST00000344920 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MUC4-204ENST00000349607 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TMPRSS4-220ENST00000618855 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 NDST1-207ENST00000523767 3449 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TFIP11-217ENST00000619735 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011330.1-201ENST00000510070 3235 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO1H-201ENST00000310903 4364 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms