Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms