Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms