Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms