Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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